1981年，为了贯彻中共中央《关于开放历史档案的几点意见》，中国第一历史档案馆、中国第二历史档案馆联合创办《历史档案》杂志，刊载明清及民国档案史料，兼发相关研究论文。曾三同志在创刊号上阐明刊物的宗旨和定位时写到：“为历史研究服务，通常的是我们拿出历史档案来，让历史研究人员阅览、摘录，好象我们再用不着做什么工作。这种看法是不正确的。开放历史档案以后，我们除了接待好利用者到档案馆来阅览、摘抄、复制档案以外，还要公布历史档案。而公布历史档案，主要又是根据客观上的需要，有系统有计划地编辑、出版专题档案史料汇集，使历史研究工作者获得系统的史料。同时还要通过报刊公布历史档案。《历史档案》杂志，就是为这个目的而创刊的。所以说，这个刊物，是公布历史档案的一个阵地，是加强历史档案工作者同史学研究工作者之间的密切联系的一个纽带。”

　　刊物问世后，深受海内外学术界欢迎，但明清档案和民国档案合为一刊，对于史学界来说，甚感不便。1984年5月第一次中华民国史国际学术讨论会期间，编辑部就如何提升刊物质量举行座谈会，与会学者倡议明清和民国档案史料、史论应该分刊。两家举办单位经过协商，采纳了这个倡议，《历史档案》由中国第一历史档案馆主办，专刊明清档案史料、史论，中国第二历史档案馆另办一个刊载民国档案史料兼为民国史研究提供园地的刊物，定名为《民国档案》。

　　《民国档案》肩祧档案、史学两个学术领域，是沟通档案界和史学界的桥梁。在档案界，她属于档案史料期刊（有别于档案工作类期刊和档案学期刊），是档案馆展示馆藏的窗口和园地，在史学界，她不仅提供档案史料，还为学者们发表最新研究成果提供阵地。创刊以来，蒙读者、作者厚爱，稿源充足，发行量稳定，被索量、被摘量、被摘率、被引量诸项指标均保持在较高水准，学术质量、学术影响得到海内外公认。