1927年4月南京国民政府成立，5月16日设交通部，直隶于国民政府。1928年10月，国民政府实行五院制后，该部改隶于行政院。

　　交通部成立时，沿用武汉国民政府公布的组织法。1927年8月修正交通部组织法，规定该部管理、经营路政、电政、邮政、航政并监督民营交通事业，为全国最高交通行政机关。

　　交通部设部长1人，综理部务并监督所属职员及机关。部内设总务厅和路政、电政、邮政3司及参事、秘书等人员。其职掌如下：

　　总务厅：分设4科。掌理文件收发、保管；编制统计报告并公布部令；典守印信；经费预决算、出纳；保管财产、物品等事项。

　　路政司；分设4科。掌理铁路、公路的建设、管理、经营及监督民营铁路等事项并兼理航政事务。

　　电政司：分设3科。掌理电信之监督、考核事项。

　　邮政司；分设2科。掌理邮政之监督、考核事项。

　　嗣后该部增设参事厅、技术委员会（后改为技术官室）、购料委员会及交通职工事务委员会等机构。

　　1927年11月，增置次长1人，辅助部长处理部务。总务厅改为秘书处，仍设4科；又增置航政司，下设3科，分掌筹划航业之设备与建设；管理航业之经费和监督公有及民营航业。后因筹办航空事业，增设第四科。

　　1928年5月，增设总务处，下分5科，掌理原秘书处事务。秘书处则只掌部长交办事项。同年，该部派员接收北京政府交通部，在北京设置档案保管处。

　　1928年II月，铁道部成立，交通部职掌范围缩小，仅管理并筹办全国电政、邮政及监督民办航业。置部长、政务次长、常务次长各1人。部内设秘书、参事、技术3厅，总务、电政、邮政、航政4司。除电政司因电政总局裁撤，其所掌事务归并该司办理外，其余各司职掌未变。

　　此外，增设扬子江水道整理委员会、法规委员会、交通史编纂委员会（与铁道部合设）。

　　1930年，邮政司增设第三科办理民用航空事业。

　　1931年，常任次长改称常务次长，并增设会计长办公处，总务司原掌理会计事项，全部划归会计长办公处办理。

　　1938年1月，铁道部裁撒，其掌理业务复归交通部，全国经济委员会管辖之公路处也归并该部。此时，交通部的职掌为规划、建设、管理、经营全国国有铁道、公路、电政、邮政、航政并监督民营交通事业。因业务范围扩大，遂将人事、材料、财务三项事务，设专司

　　办理，部内设秘书、参事、技术3厅，总务、人事、财务、材料、路政、电政、航政7司，会计处、邮政总局和公路总管理处。其职掌如下：

　　总务司：下设5科，分掌文件收发、分配、撰辑、保存与部令公布；典守印信；刊行出版物及经费出纳；财产、物品保管与其他庶务事项。

　　人事司：下设4科，分掌该部及所属机关职员之任免、奖惩、训练、教育、待遇及卫生事项；管理所属学校。

　　财务司：下设综核处及4科，分掌该部及所属机关预算、决算、计算书编制、审查及款项支配、保管；债务整理与偿还；交通建设之经营扩充筹款；财产处理；土地收买等财务事项并监督民营交通事业之财务工作。

　　材料司：下设采购处及3科，分掌材料采购、保管、稽核、支配转运；材料调查、检验、监制及技术设计；材料账目登记、审核、统计等事项。

　　路政司：下设5科，分掌筹划铁路建设、铁路业务管理及附属营业；管理铁路工务、机务以及关于公有及民营铁路之监督等事项。

　　电政司：下设4科，分掌筹划建设和管理、经营电信、电话、广播及电气交通事项，并监督公有、民营电气交通事业等有关电务事项。

　　航政司：下设3科，分掌筹划航业、航空设备及建设；管理航业、航空之经营并监督公有及民营航业、航空等有关航务事项。

　　秘书厅：掌理机要文件及部次长交办事务。

　　参事厅：分法规、方案、编纂3组，掌理撰拟、审核该部法案、命令。

　　技术厅：分土木、桥梁、机械、电工、号志5组，新路工程处与材料试验所。

　　会计处：分设4科，掌理该部及所属机关岁计、会计。

　　统计室：掌理该部及所属机关统计事项。

　　邮政总局和公路总管理处见另文。

　　1939年8月设公路运输总局。

　　1940年统计室改为统计处，又增设驿运总管理处。

　　1941年军委会设运输统制局主管公路工程及运输，并将交通部公路总管理处及公路运输总局移并该局。1943年3月运输统制局结束，公路业务及有关机构又改归交通部，设公路总局办理。

　　1943年7月，电政司改为邮电司，人事司改为人事处，并增设材料供应总处、电信总局。

　　邮电司下设5科，分掌邮政、邮政储金、汇兑及简易人寿保险；电报、电话、广播等电气交通建设或经营之规划核议，并监督公有、民营及专用电报、电话、广播等电气交通事业。

　　1945年1月，军委会再设战时运输管理局，接管交通部所掌公路部份的职能及有关机构。

　　至1945年12月底，交通部设有秘书、参事、技术3厅，路政、邮电、航政、财务、材料、总务6司，人事、会计、统计3处。此外，还设有设计考核委员会、交通复员准备委员会、交通技术标准委员会等。

　　1946年1月，战时运输管理局撤销，公路之经营管理权又归还交通部。

　　1948年10月，该部设技术、参事、秘书3厅，总务、财务、材料、航政、邮电、路政6司，统计、会计、人事3处以及设计考核委员会、日本对华赔偿交通委员会、日本赔偿物资运输处、交通技术研究所筹备处、交通技术标准委员会、船舶技术规范设计委员会、领用物资委员会、诉愿审议委员会等。

　　交通部附属机构较多，先后设立的主要机构如下：

　　铁路方面；有各铁路管理局、工程局、保管处、铁路公司及滇缅铁路督办公署、铁路测量处、铁路总机厂、东北运输管理局等。

　　公路方面：有公路总管理处、公路运输总局、公路总局等。

　　邮政、电信方面：有邮政总局、邮政储金汇业局及电信总局等。

　　航政方面：有国营招商局（后改为招商局轮船股份有限公司）、各区航政局、全国引水管理委员会、民用航空局等。

　　驿运方面：有驿运总管理处。

　　材料方面：有材料储运总处等。

　　人事方面：有交通技术人员训练所。

　　队警方面：有交通警察总局和东北铁路警察总局（1947年4月1日分别改称为第一、第二交通警察总局）。

　　其他临时性机构：有东南联运清理处、驻印度代表办公处及东北、台湾、广东、武汉、京沪、平津等区特派员办公处（办理接收日伪交通事业）。

　　（尹承瑜 撰）