财政部直接税署于1944年4月1日由直接税处改组而成。

　　1936年10月，财政部将原来所设之直接税筹备处，改称为所得税事务处。同时在各省市筹设所得税办事处。所得税事务处掌理全国各类所得（即营业、酬劳、利息、租赁所得）税事务。该处设

　　正、副处长各1人，秘书2人，审议2人，下设3科。

　　第一科：掌各类所得税之调查、征收、审核及免税、退税、补税事项。

　　第二科：掌税款之计算、登帐、稽核及一切会计、统计等事项。

　　第三科：掌所属各机关设置、人事调动、考绩；该处文书收发、保管；典守印信；公报编辑及庶务、出纳等事项。

　　1940年6月，所得税事务处改组为直接税处，同时将各省所得税办事处改组为直接税局。

　　直接税处掌理全国所得税、遗产税及其他直接税，并兼办印花税事务。该处设处长1人，秘书2人，下设3科。各科职掌如下。

　　第一科：掌所得税及过分利得税税务之设计、改进、推行、调查、考核；征、免、减、退案件之审核、处理；所用书表、簿册之编订等事项。

　　第二科：掌遗产税及印花税税务之设计、改进、推行、调查、考核；征、免、减、退案件之审核、处理；所用书表、簿册之编订等事项。

　　第三科：掌文件收发、缮绞、保管；典守印信；该处及所属机关职员之监督及考核；各种表单、票证、登记簿册之制印、保管及庶务、出纳诸事项。

　　该处还设有审核委员会，主管审核纳税人争议事项。

　　1944年4月1日，直接税处改组为直接税署，掌理全国所得税、过分利得税、遗产税、印花税、营业税、土地税及契税事宜．设正、副署长各1人，秘书2人，下设6科。第一科：掌理所得税、过分利得税事宜。第二科：掌理遗产税、印花税事宜。第三科：掌理营业税事宜．第四科掌理契税事宜。第五科：掌理土地税事宜．第六科：掌理该署总务．

　　1946年7月，该署调整了内部机构，将原来的6科缩编为4科。原掌契税、土地税之第四、五两科撤销，其业务划归地方财政司办理。更动后备科职能如下：

　　第一科。仍掌所得税、过分利得税事宜．

　　第二科：掌遗产税事宜，兼办特种营业税、交易所税之筹备及营业税移交未完事宜。

　　第三科：掌理印花税事宜。

　　第四科：掌理总务事项。

　　此外还设有秘书、视察、会计、统计、人事5室，分掌有关事宜；设审核委员会，主管审核纳税人争议及办理诉愿事项。

　　1948年7月21日，该署与税务署合并，成立国税署。

　　（杨璐 撰）