1938年2月，军事委员会第一部与参谋本部合并改组为军令部，直隶于军委会。主管国防用兵、情报、参谋、人事与教育及陆地测量等事宜，并有权指示、监督各军事机关及部队的参谋业务。

　　军令部设部长1人、次长2人，主任高级参谋、主任秘书、高级副官各1人，高级参谋、秘书、副官各若干人。部内设第一厅、第二厅和总务厅，并统辖战史编纂委员会、陆军大学校、陆地测量总局、炮兵指挥部、工兵指挥部、通信兵指挥部及陆海空军驻外武官等机构。各厅、室职掌如下：

　　第一厅：设4处，掌理国防作战计划的策定，命令起草及兵棋布置；军队编制、装备、调遣；城塞设计、审核及海空军有关作战事项；兵役动员及绥靖、警备；国家总动员各项计划及资源调遣、统制、整备；后方勤备的指导计划；军队教育及演习；兵要地志的调查、编纂，测量计划的审核及地图保管；战史资弩的搜集、编纂及战术、战略的研究事项。

　　第二厅：设4处。掌理敌军谍报、备战场敌情和边区谍报；苏联

　　?欧美及与敌有关之情报搜集、研究、整理、判断；驻外武官的派遣、指导及外国驻华武官的招待；谍报计划及谍报人员的训练；外侨与各国驻华兵力的登记；防范间谍及汉奸的活动；在华外人军备行动的调查整理；谍报教育、通讯与谍报技术的研究、计划事项。

　　总务厅：设3处。掌理该部职员及海陆空军参谋人员任免、考绩、恤赏；参谋教育与陆军大学校的组织及教育纲领；口令通号及陆空通讯联络事项；该部文电、章制、印信及文书收发、印制；各项会计审核及警卫、交通运输等事项。

　　高级参谋室：办理不属于各厅的机要事件及一切交办事项，审核建议、章制及临时联络的派遣事项。

　　秘书室：办理机要文件及不属于各厅之文电等事务。

　　高级副官室：办理重要命令的传达及一切联络事务。

　　1939年11月，总务厅改称第三厅，下属第三处改为总务处。增设高级参谋室、秘书室和高级副官室。1940年，将炮兵指挥部撤销，其业务由第一厅接管。1943年3月，将通信兵指挥部及工兵指挥部裁撒，其业务归并第二厅掌管。同年4月，又将陆地测量总局改为第四厅。各厅室职掌如下：

　　高级参谋室：主管不属于各厅的机要及章制的审核。

　　秘书室：主管各种文牍及部务会报的撰拟。

　　高级副官室：主管中外来宾的接待及重要命令的传达。

　　第一厅：设4处，仍掌理国防作战等事宜。

　　第二厅：设5处，仍掌理情报及驻外武官的派遣和外国武官的接待等事宜。

　　第三厅：设3处，掌理参谋人事教育及该部总务章制等事宜。

　　第四厅；设技术室及2处。主管陆地测绘及其教育事宜。

　　各厅除设上述各处外，均设有办公室，办理该厅不属于各处的文电处理及人事、会计等事务。

　　1945年8月，第三厅第一处改为人事处，其职掌不变。第四厅增设测量处，主管第一处测量业务，原第一处缩编为管理室。第二

　　?处改为制图处，其职掌不变。

　　1946年6月，国民政府军事机构改组，军令部各项职掌分别由国防部有关部门行使，该部至此结束。

　　（管 辉 撰）