汪伪政府海军部于1940年3月30日成立，直属于行政院，并受军事委员会统辖，掌理海军行政事宜。

　　该部设部长1人，综理部务，统辖海军军人、军属并指挥、监督所属各机关。政务次长、常务次长各1人，辅佐部长处理部务。参事4-6人负责撰拟、审核关于该部之法案、命令。秘书6-8人分掌部务会议、机要及长官交办事务。设技监、技正等办理技术事务。会计主任、统计主任各1人，办理会计、统计事项。设专员、副官若干人，办理长官交办事项。

　　海军部内设总务、军衡、军务、军械、军学、舰政、军需7司。各司职掌及内部机构设置如下：

　　总务司：下设机要、文书、统计、庶务4科，分掌文件收发、分配、纂辑及保管；公布部令，典守印信；编制统计报告；刊行出版物；战时征发物件表报及统计、庶务等事项。

　　军衡司：下设铨叙、典制、恤赏、军法、医务5科，分掌海军军官佐及文官之进退、任免、奖惩；休假、员兵退伍；海军军旗，标帜，礼节，服制，徽章；军法审判及典狱；战时捕获审检；卫生报告、统计及海军医院；海军军官随驻外国之派遣、褒赏及瞻恤等事项。

　　军务司：下设军事、防空、港务、巡防、测验5科。分掌海军建制、编制；舰艇、飞机之配置；舰队陆战队、空军队之调遣、校阅、操练及军风纪；军港、要港，戒严，运输，防空设备；测绘江海航路，沿

　　江、沿海标志；海上巡缉，捕获及救护，士兵征募、补充等事项。

　　军械司：下设制械、雷电、军备、检验4科，分掌各项器械、弹药制造、配置、管理、试验、检查及调查统计事项；海军台垒之建筑及布置，所属各机关、各舰队军火册报之稽核等事项。

　　．军学司：下设军官、练兵、工学、海事4科，分掌所属各学校一切章程之制定及筹办；教育纲领及计划之拟定；留外学员生之遣派；士兵之训练；造船、制钢、制械、飞机、潜水艇、测量及无线电人员之教育，教育人员之考绩、奖惩，图书审核等事项。

　　舰政司：下设造船、制机、炼铸、修缮、厂坞5科，分掌舰艇、飞机制造之设计及修缮；船舶之舣装；筹划炼钢；厂坞之管理；舰艇板具之稽核等事项。

　　军需司：下设稽核、出纳、经理、储备4科及海军煤栈，分掌军服之经理及核查，军服粮煤给与之规定；平时、战时粮煤之给与及战时粮煤之准备；现金出纳、保管；规定俸给及旅费；军需人员之考绩、奖惩等事项。

　　1942年9月海军部调整机构，撤销军械、军学、舰政3司，增设军枢司、秘书处、副官室。总务、军衡、军务、军需4司保留，但职掌变化较大。

　　调整后各司、处均分设2科。各司、室、处职掌调整如下：

　　秘书处：掌理机要，文书，典守印信，审定文稿，翻译及图书管理等事项。

　　副官室：掌理宣传、典礼、交际、警卫及长官交办调查事项。

　　总务司：掌理有关法令之‘撰拟及审核；公布部令；编制统计报告；刊物编辑发行；订定海军法规；海军建制，编制，海军军旗、标帜、礼节、服制、徽章，会议及海军宣传等事项。

　　军枢司：掌理有关法令之撰拟、审核；江海防务计划；舰艇飞机配置，作战计划及戒严；军港、要港之防卫及建设计划；防空设备；江海巡缉、私运捕获及救护海难；情报搜集、通报；舰队、陆战队调遣；测绘江海航路，沿江沿海标志等事项。

　　军衡司：除原职掌外，并接办原军学司职掌。

　　军务司：原职掌除分别划归总务司、军枢司事项外，保留掌理军风纪、校阅、操练事项，并接办原舰政、军械二司职掌及原军衡司掌理的军医事项。

　　军需司：职掌不变。

　　1944年6月海军部再次修正组织法，明确规定该部除掌理“全国”海军行政外，并负责职掌海军军令事宜。同时将副官室改称副官处，职掌未变，并在军衡司下增设一科，掌理军法审判及侦查执行事项。

　　海军部直辖机构先后设有中央海军学校、水路测量局、中央水兵训练所、要塞司令部、各基地部等。

　　（张强林 撰）